Kira est un jeune étudiant d'Heliopolis. Elève assez timide et doué, il passe son temps avec ses amis et son petit robot en forme d'oiseau crée par son meilleur ami Athrun, qu'il conserve toujours avec lui...
Kira est quelqu'un d'assez introverti. Il est bloqué par un dilemme. Lorsqu'il a fuit Heliopolis, il a découvert qu'Athrun Zala, son ancien meilleur ami, était devenu un soldat de Zaft.
Quand à Kira, il se doit de défendre l'Archangel. Il est donc déchiré entre le fait de combattre son meilleur ami, mais aussi d'essayer de protéger ses nouveaux amis...
Comparé aux autres Coordinateurs, Kira est très fragile, il se reproche aussi d'être impuissant face à plusieurs situations dangereuses durant son voyage dans l'espace.
Kira est un Coordinateur, (un être humain dont les gènes furent modifiés à l'état embryonnaire) ce qui fait de lui une personne aux capacités physiques et intellectuelles supérieures par rapport aux êtres humains 'non modifiés', dit les Naturels. Un commando de Zaft va s'introduire sur la colonie, voler des Gundams construits secrètement pour l'Alliance sur celle-ci et Kira, pris au milieu de ces événements verra sa vie changée à jamais. En effet, en aidant Murrue Ramius, qui fera tout pour empêcher le vol du dernier Gundam, il se dresse face à son meilleur ami, Athrun Zala, membre de Zaft qui devait voler ce Gundam.
Ayant seul les capacités pour piloter le robot, il sera en quelque sorte 'enrôlé' de force. Mais s'il se bat, c'est pour ses amis, embarqués à bord de l'Archangel avec lui. Il déteste la guerre, il est hypersensible, et a du mal à prendre des décisions car il ne veut blesser ni tuer personne (mais il n'a pas le choix). Cependant, il lui arrive de devenir berserk, et quand il maîtrise cet état, il est encore plus puissant: cela s'appelle la 'Seed'.
Il se sent responsables de tous les morts qu'il ne peut empêcher (notamment celle du père de Flay, des civils qu'il a aidé) et cela l'affecte terriblement. Cette fragilité permettra à Flay, dont il est amoureux, de le manipuler à ses fins. Il finira par mettre fin à cette relation néfaste, et après avoir aidé l'équipage de l'Archangel, il rejoindra Orb, un groupe de résistants qui prône la paix entre Naturels et Coordinateurs. Son ex-ami Athrun le rejoindra avec Lacus, et ils redeviendront amis.
Kira apprendra plus tard que la fille du chef d'Orb, Cagalli, est en fait sa soeur. Tous deux se ressemblent assez physiquement.
Dans Gundam Seed Destiny:
Kira tient un orphelinat sur Orb avec Lacus. Après la tentative d'assassina de cette dernière, ils décideront de reprendre l'Archangel pour essayer de mettre fin a la guerre comme la dernière fois. Kira protége l'Archangel mais plus principalement Lacus dont il est amoureux.